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25/01/2010

Algorithmes et combinatoire du texte et applications en bioinformatique

Les 25 et 26 janvier 2010 se tiendront à Montpellier les journées Algorithmique, combinatoire du texte et applications en bio-informatique.

Elles sont organisées conjointement par l’axe "analyse de séquences" du GDR Bio-Informatique Moléculaire (3003) et le groupe de travail COMATEGE du GDR Informatique Mathématique.

Les thèmes abordés vont de la combinatoire et de l’algorithmique du texte et leurs applications à l’analyse bio-informatique des séquences biologiques. Cela inclut les sujets suivants, sans y être limité :

-  algorithmes du texte
-  structures d’indexation
-  combinatoire des mots
-  recherche, découverte et analyse de motifs
-  statistique des mots
-  analyse de séquences
-  cartographie et annotation des génomes
-  haplotypes et polymorphismes
-  approches ab initio et approches comparatives
-  méthodes de génomique comparative
-  outils d’analyse des répétitions génomiques
-  analyse des données de séquençage haut-débit (SHD, NGS)

Les exposés seront organisés par session avec des sensibilités plus informatique, mathématique, ou bio-informatique.

L’inscription est gratuite mais obligatoire. Vous pouvez vous inscrire ou proposer un exposer dès maintenant. Les modalités sont disponibles à http://www.lirmm.fr/mab/gtseq

Dates importantes :
-  30 11 2009 : limite de soumission des résumés
-  23 12 2009 : notification aux auteurs
-  06 01 2010 : date limite d’inscription.
-  25-26 Jan 2010 : workshop


see online : Page du workshop